В 2008 году на обеспечение антитеррористической защиты пассажиров, грузов и объектов инфраструктуры Омского отделения ЗСЖД направлено более  30 млн. рублей.

Для обеспечения безопасности,  предотвращения возможных случаев вмешательства в работу   Омского отделения железной дороги в течение 2008 года проведен ряд работ по ограждению территорий объектов и станций. В общей сложности установлено более 11 км ограждения, выполненного  из металлического профиля и железобетонных плит. Это позволило исключить беспрепятственное проникновение на территории железнодорожных объектов.

Кроме того, в прошлом году на сортировочной станции Московка внедрена современная  система видеонаблюдения, которая не только обеспечивает защиту объекта, но и позволяет использовать ее в  технологических процессах по переработке поступающих грузопотоков.

Современными системами видеонаблюдения  были оборудованы также железнодорожный вокзал в городе Исилькуль и административное здание Омского отделения  железной дороги.

На отделении регулярно проводятся совместные учения и тренировки, направленные на отработку действий железнодорожников,  сотрудников транспортной милиции и ведомственной охраны  при возникновении различных ситуаций, связанных с обнаружением бесхозных подозрительных предметов и поступлении анонимных звонков об угрозе взрыва.